1997 yılında kurulan Veteriner Fakültesi bünyesinde faaliyet gösteren Patoloji Anabilim Dalında, öncelikle ülkemiz için sorun oluşturan hastalıkların tanı, tedavi ve önlenmesine yönelik çalışmalar yapılmakta, hem lisans hem de lisansüstü eğitimler ile bu alanda hizmet verecek deneyimli elemanların yetiştirilmesi amaçlanmaktadır. Fakültemiz; İç Anadolu'yu, Doğu Anadolu ve Karadeniz Bölgesine bağlayan ulaşım yolu üzerinde bulunduğundan oldukça yoğun hayvan hareketleri ve koyun-keçi  populasyonu bulunan bir coğrafya merkezinde kuruludur. Bu nedenle, özellikle enfeksiyöz hastalık yelpazesinde görülen çeşitlilik, bizi büyük ekonomik kayba yol açan sorunların ortaya konulması ve giderilmesine yönelik çalışmalara yöneltmiştir. Patoloji Anabilim Dalı’nda nekropsi ve histopatolojik tanı hizmetlerine, 2004 yılından itibaren İmmunohistokimya laboratuvarının kurulmasıyla birlikte başlıca enfeksiyöz hastalıkların (BVD, Border, PPR, Toxoplasmosis, Neosporozis vb.) immunoperoksidaz test ile rutin etiyolojik tanısı eklenmiştir. 2007 yılında, Moleküler Patoloji ve Hücre Kültürü laboratuvarlarının kurulması ile Toxoplasma gondii ve Neospora caninum etkenlerinin invitro kültürü, konvansiyonel PCR, Real-Time PCR, In-situ hibridizasyon ve immunositokimya çalışmalarına başlanmıştır.